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7月20日（暑假第一天）
上午——午前
「虚空爆炸案」的嫌疑犯陷入原因不明的昏迷中。
美琴与白井两人去医院调查此事，在医院内与研究员木山春生初次会面。
上午
上条与挂在阳台上出现的茵蒂克丝相识，并请她吃东西。
上条与茵蒂克丝在宿舍分别后去学校补习，月咏小萌老师出场。
下午——傍晚时分
佐天从网上下载到载有「幻想御手」的音乐cd，找到初春饰利，想炫耀一下。
美琴、白井与木山春生在医院外的吃茶店内聊天，佐天和初春半途加入，由于从谈话中得知「幻想御手」具有危险性会被收走，佐天并没有说出自己得到音乐cd的情况。
各自分别后，美琴察觉到附近有上条的存在，前去找他。
下午——晚上
补习后的上条在回宿舍的路上遇到美琴，不过美琴却被上条哄吓住，两人就此分别。
回到宿舍的上条见到倒在血泊中的茵蒂克丝，与前来追捕她的魔法师史提尔·马格努斯交战。
上条利用消防洒水器，淋湿了史提尔的符文卡片，封死了他的必杀技「狩猎魔女之王」，将史提尔击败，并背着茵蒂克丝从宿舍逃脱。
上条将负伤的茵蒂克丝带往小萌老师家，茵蒂克丝借助小萌老师施展「恢复魔法」治愈伤口。
7月21日
上午——
茵蒂克丝苏醒，上条开始借住小萌老师家里让她疗养身体。
白井黑子从初春以及木山春生处调查到「幻想御手」的实体是音频软件，于是前往某交易地点调查。
在交易地点出现的佐天被不良混混抓住，白井及时出现并与不良们展开战斗。
白井用摧毁废弃大楼的办法战胜了拥有「偏光能力」的不良头目。
7月23日（7月、第四个星期五的三天前）
女杀手史蒂芬妮·哥杰斯巴莱斯否定同行兼老师的砂皿致密的狙击暗杀风格。
7月24日
上午——傍晚
佐天的友人因使用了佐天提供的「幻想御手」而陆续昏迷，佐天泪子在与初春通电话后也陷入昏迷，全员被「冥土追魂」的医院收治。
赶到医院的美琴与白井从「冥土追魂」处得知制作「幻想御手」网络的脑波频率与木山春生相似，判明犯人。
前去与木山春生谈话的初春无意中发现她的秘密，被木山带走。
木山利用「幻想御手」所得到的「多才能力」，将拦截她的警备员全部击溃。美琴赶到出事现场与木山对峙。
在两人的交战中，美琴通过电磁波与木山春生[幻想御手]脑波网络进行了连接，得知了她的记忆。
被美琴击败的木山春生从身体之中泄露的aim扩散力场形成了一个形似胎儿的迷之生物体「幻想猛兽」，美琴之后与处于暴走状态中的「幻想猛兽」交战。
初春饰利在警备员的帮助下播放木山给予她的「幻想御手治愈音频程序」，「幻想猛兽」防御能力被瓦解。
变弱的「幻想猛兽」最终在美琴的「超电磁炮」攻击下消失。
木山春生被逮捕，因「幻想御手」而昏迷的人群全部苏醒，「幻想御手」事件结束。
初春去医院看望已经苏醒的佐天泪子。
晚上——
茵蒂克丝痊愈，上条决定带她去澡堂洗澡。
在去澡堂的路上上条初次遇到了同样前来追捕茵蒂克丝的魔法师·神裂火织。
上条在与神裂的交战中败北，被神裂击晕。
「幻想猛兽」战斗结束八小时后，美琴与白井因违反宿舍的门禁时限被常盘台中学宿舍的舍监逮住。
7月25日
作为违反门禁的处罚，美琴与黑子两人负责打扫学校的游泳池。
美琴此时结识了黑子的同学湾内绢保和泡浮万彬。
七月、第四个星期五（7月26—27日两天皆有可能，日版资料偏向于26日）
狙击手砂皿致密替完不成暗杀任务的史蒂芬妮·哥杰斯巴莱斯善后。
7月27日
晚上——
昏迷三天后的上条当麻苏醒，并从神裂和史提尔口中得知午夜时分将要消除茵蒂克丝的记忆。
心有不甘的上条从小萌老师通电话中得到启示，解开暗藏在茵蒂克丝大脑中的秘密。
7月28日
午夜00：00—
上条将茵蒂克丝口中的魔法符文破坏，「自动书记」启动，开始操纵茵蒂克丝用魔法攻击上条。
处在战斗状态下的“茵蒂克丝（自动书记模式）”释放的魔法「龙王的叹息」将漂浮在宇宙的人造卫星「织女一号」摧毁，搭载在卫星内的超级电脑「树状图的设计者」同时被毁。
在史提尔以及神裂的帮助下，上条终于摧毁了控制茵蒂克丝的「项圈」，不过他却从此失去了过去的所有记忆。
下午——晚上
上条在医院苏醒，见过探望他的茵蒂克丝后与医生「冥土追魂」谈论起自己失忆的事情。21：40（超电磁炮33话）
学院都市的搜索队将「树状图的设计者」的一部分“残骸”回收。
7月30日
超电磁炮33话
通过对“残骸”的解析，学院都市高层得知「树状图的设计者」被来源不明的大规模热源所摧毁。
8月1日
运送卫星燃料的货车被恐怖份子远程遥控，发生紧急事件。
警备员黄泉川爱穗与风纪委员初春饰利合力确保货车以及司机的安全。
狙击手砂皿致密接受警备员的委托，使用钢铁破坏者(metaleater)破坏了货车必定要前往的桥梁。
在初春以及黄泉川的努力下，货车安然无恙。
事件结束时，美琴和白井正准备去逮捕幕后主使者。
8月8日
上条和茵蒂克丝一起去购买参考书，中途遇见自己的同学蓝发耳环。
三人于是又去冷饮店吃东西，在店内与穿着巫女服的少女——姬神秋沙相识。
史提尔·马格努斯通过结标淡希的「坐标移动」能力来到了一栋没有门窗的大厦，与学院都市统括理事长亚雷斯塔·克劳利会面。
在冷饮店内的姬神向上条借钱，随即被几位黑衣人带走。
史提尔·马格努斯找上上条，并要求他一起去解救被关押在三泽塾补习班的姬神秋沙——拥有「吸血杀手」能力的少女。
两人进入三泽塾补习班并将炼金术师奥雷欧斯·伊萨德的「分身」击破，但却被真正的伊萨德用「金色大衍术」消除部分记忆。
茵蒂克丝出现在三泽塾补习班，被伊萨德带走。
上条在「幻想杀手」作用下恢复记忆，并在补习班外围目睹罗马正教骑士团施展的魔法「葛利果圣歌」被伊萨德用「金色大衍术」反弹。
上条和史提尔回到三泽塾补习班与伊萨德进行最终战斗，上条右手被斩断，从断腕处出现的「龙王之首」致使奥雷欧斯·伊萨德败北。
8月9日
上条的右手被医生「冥土追魂」接回，史提尔和茵蒂克丝来看望他。
上条从史提尔处得知奥雷欧斯·伊萨德从此失忆，但却被史提尔用火焰进行了整容以躲避追杀，从此踏上新的生活。xh211手机用户看动漫二次元请浏览https://m.shuhaiju.com/wapbook/5176.html，更优质的用户体验。