元首办公室里，沈森拿着调查团第一次提交上来的内容，看着那里面熟悉既陌生的世界，开口对眼前的人问道。
“帝国的智能机器会发生大规模的叛变吗？”
“绝对不会，它们只是遵循严密代码和指令逻辑的产物，只要没有人在它们的智能系统里设计相关的程序，那么就永远不会发生您担忧的这种情况。”
“哦……”
沈森没有肯定，也没有否定。
面对群星帝国在智能机器领域研究最深的科学家海默院士，沈森心里是倾向于相信这个说法。
不过新世界黑客帝国中已经发生的现实，却让这个答案出现了一丝裂缝。
按照海默博士的理论，为什么黑客帝国会出现叛乱？
这个问题电影剧情里没有明说，但是无非就那么几种情况。
第一，可能是有人故意设计了一种可以感染全部机器的病毒程序，导致它们集体产生了反抗人类的指令。
第二，可能有一个运算能力强大的智能机器人运行中出现了逻辑错误，导致它首先产生了反抗人类的指令，之后控制了其他机器，类似电影中的机械帝一样。
第三，也是沈森最不想看到的一种情况。那就是黑客帝国被所谓的亚空间混沌能量腐化了，这种神奇的能量使得他们产生了某种变异情况。
见到沈森不说话，海默院士想了想继续解释道:“人类的头脑是一个复杂的超混沌动力系统，有正的李亚普诺夫指数和拓扑熵，人类思考时的非逻辑性跳跃性会帮助人类产生一些很新鲜的思想。
而且一些表面上看来无用的想法思路研究，也会被人类社会所保留，并在一定程度上得到开拓发展，成为未来可能具有重大实际意义的理论创新的萌芽。
任何真正伟大的创新一开始很可能被认为是没有实际用途的空谈，群论，拓扑学，黎曼几何，集合论等等一开始都被认为是抽象的数学理论游戏，没有什么实际意义，但后来却成为现代科学的基础。”
而如果存在一个机器智能文明的话，他们的思维严格遵循逻辑运算，而且一旦发现无用的思维或程序，总是加以删除或限制。
这样一来，会严重阻碍他们理论创新能力的发展，也就严重阻碍了他们文明的进化。
所以即使他们能够取得一时的胜利，但是不会获得最终的胜利。”
“海默博士，我相信你的理论是正确的。”
沈森听完这句话，笑了笑，终于肯定了这个理论。
因为他发现当这套解释应用到黑客帝国的世界中时，刚刚好能够解释智能机器建立矩阵的目的。
电影里，那些机器自己也意识到了这一点。
但仅仅意识到这点是不够的，因为仅仅是放任无目的程序的存在和泛滥，并不意味着机器文明能发展出自己的创新能力来。
一方面这会导致无法预料和控制的结果，有时这种结果可能是毁灭性的。
这是由机器文明信息交换速度极高，至少几十万倍于人类，以及整个机器智能系统高度复杂性决定的。
另一方面即便那些有潜力发展成为真正的创新的无目的程序，如何能发展成长起来，不被杀毒程序清理，不被埋没浪费，也是一个问题。
所以机器智能文明实际上处于两难境地，严格执行无用程序删除或限制的原则，则他们文明永远只能在一个水平上重复，而不会出现真正革命性的进步。
但如果不严格执行这个原则，那么他们的整个文明本身的生存都有可能受到威胁。
正是出于这个原因，他们设立矩阵系统来尝试解决这个两难问题。
利用人类在矩阵系统中产生的创新的思想火花为自己的进一步发展提供动力，这是矩阵作为能源的真实用意。
一开始机器文明确实单纯地想要这种方式一劳永逸的解决问题，但是矩阵系统的运行并非如此顺利。
所以当机器文明设立第一个矩阵的时候，他们可能仅仅是单纯的榨取人类头脑中的创新。
不过他们或许准备了两种可能性。
如果这个系统运行顺利，就把人类一直利用下去。
否则就采取矩阵升级的战略，直至矩阵革命，彻底摆脱人类。
电影里代号为“建筑师”的高级智能程序设计的第一个完美矩阵系统的崩溃，表明人类的头脑有太多的不确定性不稳定性，并不是一个信任依赖的工具。
于是从第二代矩阵开始，设立了先知负责研究人类的心理，研究最终如何摆脱人类，使机器文明具备独立创新的能力，同时也建立了包括主角尼奥这个程序，锡安世界在内的一系列配套的矩阵升级机制稳定机制。
这样矩阵有两个任务，一个任务是榨取被接入矩阵中的人类头脑中的创新思想。这个任务由智能程序建筑师来负责。
另一个任务是研究如何使得机器文明获得摆脱人类独立进行创新的能力，同时又能保证机器文明本身的安全，防止出现无法预料无法控制的结果，这个任务是由先知来完成。
所以建筑师竭力保持矩阵的平衡，并负责对矩阵定期升级，而先知则在矩阵中研究人类心理。设法找出人类创新能力的奥秘，并寻找机会，促使平衡打破，使矩阵革命的条件成熟。
而电影里曾经出现的三个主要角色，沈森也对他们的身份有了一丝猜测。
黑人墨菲斯，女主角崔妮蒂，主角尼奥都是一个电子人。他们自认为自己的思想和意识是自由的，但是有很大的可能那些意识思维都是矩阵给予他们的。
墨菲斯可能是个权限很低的人物，他的作用是救出尼奥的身体，初步启迪尼奥，引导尼奥回到矩阵的电脑主机，交出身上携带的密码。
墨菲斯来自于母体，他的思想局限于母体的安排。到了后期，尼奥回到了万物之源，但是战争依然没有结束，所以墨菲斯整个人才蒙了。
这时候他才发现自己被骗了，他并不知道自己也是高级程序先知的一枚棋子，自己所有的动作只是矩阵在自己潜意识中的安排，所以这个时候他的信仰崩溃了。
而女主角崔妮蒂是一个更悲催的人物，她在矩阵中的权限比墨菲斯要高，她可以复活尼奥，是这次矩阵升级的关键变量因素，决定这尼奥的思想行动。
崔妮蒂和尼奥的爱情，产生了矩阵不可控制的行为。这种行为进一步加剧了人工智能机器的危险，最后尼奥通过自我牺牲达成短暂的和平协议。
崔妮蒂表面上是一个自由人，其实是被高级智能程序先知控制的，思想的控制。
先知告诉她她会爱上一个人，然后她就偷偷的在母体中观察尼奥。然后假装爱上尼奥，然后真的爱上了。
这种爱情是人类思维意识的奇妙之处，身为高级程序的先知和建筑师并不能真正的明白其中的意义，产生的行为也是他们两个不能控制的，所以才产生了尼奥的反面程序史密斯。
尼奥是电影的主角，他的本体是个电子人，和千千万个矩阵中的人一样，他的脑部是改装过的，他有人类的基因，电脑人的接孔，思想完全受母体的控制，他的所有行动都被母体记录下来。
在纯种人类世界中，他是被人怀疑的救世主，在锡安反抗基地并不是所有人都相信他，主流的议会就不相信他，强势的指挥官不相信他，即便是飞船舰长中，很多人依然不相信他。
尼奥身上带着机械大帝和矩阵的所有权限，但是这种权限必须一步步才能得到，而且必须是有顺序有步骤的获得。开始的尼奥就是个普通电脑人，浑浑噩噩的过日子。
在矩阵的虚拟世界里对于上司的训斥逆来顺受。晚上思想千千万，早晨起来接着干，怀疑的思想虽然强烈，但是毫无作为。
而墨菲斯之所以救出尼奥的，是高级智能程序先知告诉他的。
从这一点可以看出，墨菲斯根本就是个洗脑人。
他看似有着坚定的信仰，但是不知道这种信仰的目的和来源，这种信仰是程序先知告诉他的，先知有自己的目的，所以，墨菲斯就是个传话人，执行者。一个自以为掌握命运的执行者，这恰恰是先知和母体的目的和设定。
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