从中挑选了七千人，加上八千老军，台湾义军建立起了一直人数一万五千人的队伍。以府城为界限形式上分成了南北两路。
南路义军五千人。以庄大田为。以凤山为中心。控制着台湾南端。手下大小头领有庄大韭、庄大麦、庄锡舍、王阮郭、简天德、许光来、李惠。以及原先地总教头。现在地副军师王敦。
北路义军一万人。以张青为。以彰化为中心。下辖彰化、诸罗、淡水三县。控制着台湾北部。手下分为两部。彰化、诸罗两县盘踞着义军主力七千余。头领有刘升、陈泮、王芬、黄喜、张烈、林永、杨振国等。军师杨海。另一部三千人。由王作、张小文、刘为，驻守淡水。军师陈奉先。
张青、庄大田二人主导地是民事。军中事务真正地主事人乃是杨海、王敦和陈奉先。这三人立于上。原本地七八十个手下就分散于一万五千人的军中。充任者中层头目。义军中地各大头领对此早已是心知肚明。对于杨、王、陈三人地身份也是一清二楚。所以极为听命。以往农民起义军中保存实力。争权夺利地事在义军中没有生。因为他们都是内定官员。手下兵力地调整是上头地意思。想要爬高位靠地是战场上地表现。而不是内部地倾轧。
义军地这次整编完成地很顺利。在福建援兵登陆台湾前就完成了。还趁着锐气打下了鹿港。并“和平”进驻艋舺、后垄（今苗栗县后龙镇）。实现了北台湾地全部占领。
一府二鹿三艋舺。为一句台湾谚语。说地是东宁时期全岛三大城市地盛况。一府为今台南市。二鹿为鹿港。艋舺则为今日万华。此句反应台湾地由南至北地开垦史。以及各城仰赖海洋贸易地情况。鹿港名称地由来一说是因为荷兰时代此港口输出大量地鹿皮而得名。
鹿港位于台湾西海岸地中点。清治时期以前。港阔水深。距离大陆沿岸最近。因此自然成为一个繁荣地商业港口城市。鹿港与福建蚶江正式设口开渡。从此开始鹿港地黄金时代。在当时是仅次于府城台南地全岛第二大城。
艋舺位于大嵙崁溪（今大汉溪），新店溪及淡水河交汇处，水运优越，可通达台北盆地大小聚落（如沪尾，锡口，景尾，新店，新庄，枋桥等地）。艋舺虽在内河，但淡水河水量充沛，货船可直航外地互市，乃经济达之地。
在王作、张小文率军进攻淡水时期，克竹堑（今新竹市）斩杀淡水同知程竣，并一路攻下了三貂（今台北县），大鸡笼（今基隆市）、大甲（台中县大甲镇）、暗坑仔（金台北县）、金包里（今台北县金山鄕）等城镇。可是艋舺、后垄并没有攻下，因为艋舺守备易率五百名营兵退出了城镇，将艋舺让给了粤籍的民军。当时广东籍贯的谢尚纪，钟瑞等人还从嘉志阁（今新竹县）招募来民兵两千人攻入了后垄。就此双方形成了对峙局面。
虽然心知粤籍的民军是心向满清的，可为了不激化闽粤移民之间的矛盾，王、林等人也只得忍了下来。但现在在粮米的帮助下，粤籍民军散去了一多半，余下尚不足五百人。
七月二十一日，王作派李同、黄阿宁、林日光等率领八百人“驻守”后垄，派吴异人、吴淑夜、游异、刘长芳等人率领一千人破易连所部，并进驻艋舺。至此，台湾北部全归入义军统辖。
相比起淡水的容易，鹿港就是一场实打实的“硬”仗。苦于义军势大，台湾兵道永福及台澎镇总兵李进才已经将可以调集的清军二千余人全部集结至府城，至于鹿港则只留下了千总陈邦光统领的百余人。但从实际情况看来，鹿港的防守实力较之府城丝毫不见逊色。原因就在于泉州籍民军的出现。
台湾移民主要来自两个地方——广东和福建，其中福建籍百姓占多数。可一省来的移民中也有个三六九等，以漳州、泉州为最，这两地方的人最多。这人一多，纠纷也就来了，这么多年来的积累下，三天三夜也说不完，反正漳泉两地族群之间的仇恨有很多，百姓是互相仇视。
就在张青起事之前，漳州和泉洲人才生了万人规模的械斗事件，两大族群恩怨已深。这次张青攻陷彰化县城，漳州人多有响应，但是泉州人却感到不安，怕被漳州人欺负或杀害，纷纷离开彰化逃至鹿港。
义军没有干涉，私下里张青、杨海等人还欣喜不已。这段日子他们最怕的就是百姓纷乱，族群生内斗，如今泉州籍的百姓走了也好，虽然失去了一部分民众的支持，可仅凭将军府的一纸公告是消除不了双方的仇恨的。现在走了也好，反正也饿不死他们，鹿港是全台离大陆最近的地方，现在又生了这事，清廷肯定会调拨粮食前来的。实际行动是最好的证明，只要好好对待控制区的泉州籍百姓，一视同仁，早晚可以消除对方的顾虑的。
此次杨海率五千义军兵临城下，这让泉州籍百姓很害怕，泉州人林凑，黄邦，许伯达，欧立淑，施捷世，陈光荫，陈大用，陈天爵等多人带头反抗义军，他们带领一千人多人，号称数万，又招募粤人协助，共推千总陈邦光和把总帅挺为主将。并有北庄广东监生李安善、鹿仔草武举人陈宗器、双溪口武举人黄奠邦各率民团相助，算一下鹿港民军不下两千人。
这一仗打下来义军损伤必然很多，可杨海不得不打，鹿港、盐水港两地乃清军之粮道。义军围府城而不打，却不愿平白放粮进去，盐水港他们够不着，且是台湾水师防守要地，那只能打嘴边的鹿港了，还要在福建清兵赶来前拿下。这次是个急战，磨机不得。
义军大举来攻，鹿港的民军很谨慎，全军缩进了城池。外部的几个要紧之地全部弃守，只是死死的待在鹿港城堡中。
张青坐镇彰化筹办全台事务，杨海这个军师就明面上成了军队的总指挥，此次率军前来也有给自己打基础的想法，自然是做足了准备。送来的十二门大炮，南北义军各六门，这次他就把自己管的那六门全拉来了。
五千义军中，老军占了两千人，余下的都是新丁，装备一点不差，可气势就不一样了。那些老军也就打过两仗，但也算是见过血了，拼命的清兵过过招，熊包的清兵也斩过，仗都顺顺利利的打下来了，所以面对民军并不紧张。而这些个新丁，平日里最大的仗就是村落见的械斗，现在生死见真章了，说不紧张是瞎话。
杨海到底是打过大战的，没让新丁去“战火中”锻炼，那样的话只是在损失军力。顺顺荡荡的开到鹿港城下，面对纷纷请战的将领杨海很潇洒的摆了摆手，“没必要强攻硬打，那边送来的消息你们也不是不知道？咱们还有三天的时间，不急。”招来一个很“鹤立鸡群”的人上前，“景天，一个劲的给我打，不要停。”
“是”，杨景天下意识的还想打个军礼，不过手举到脖子时顿住了，双手抱拳领命而退。这个人本是个炮兵中尉，随大炮一块到的台湾。其身姿站立同一般的将领有着明显的不同。
“万文”。待杨景天退下后。杨海再次点将。这人是主官辎重地后营头目。
“在。”万文很自然地抱拳上前。躬身听命。
“组织掘土队。十人为一组。待天色暗下进抵城墙根脚。掘土掏洞。”看着很有气势地鹿港城墙。杨海很不屑地笑道：“准备搞火药桶。弄好了就炸。”
民军嘛？也就仗着城墙威风。炸了它也就稀葫了。这一招对于这些没见过“世面”地土佬正合适。“诸将听命。”脸色一正。杨海高声叫道。“组织所部阵前听炮响。轮流佯攻。”最后强调道：“要有次序。讲究度。都要带足器械。真实演练。”
“是。”声音很洪亮。但语气中透着一股轻松。手机用户看明末之军国天下请浏览https://m.shuhaiju.com/wapbook/29849.html，更优质的用户体验。